工程研发部主要负责数据科学与工程学院战略方向下，系统/平台（例如水杉在线、研究生系统）的研发与运维工作，以及全院科研成果到实际产品、工具、开源项目等的工程化转换工作。除此之外，还担负学院的工程教育、专硕的工程实践基地等任务。目前工程研发部涵盖了工程开发、软件测试、云原生等领域的工作。